撰文
言笑
单细胞技术发展之初主要是单细胞RNA测序（single-cellRNAsequencing，scRNA-seq）。采用scRNA-seq分析复杂组织，能够剖析其中的转录组异质性，揭示未知的细胞类型或细胞状态。随着单细胞测序的飞速发展，研究人员发现，将scRNA-seq与另一种生物分子表征方法相结合，如蛋白谱分析，就能产生1+12的效果，有助于解决之前存在挑战的生物学问题，因此，单细胞多模态测量（Multimodalmeasurementsofsingle-cellprofiles）应运而生。
多模态测量是指在一个实验中同步测量多个模态，或是整合多个实验的不同组学数据集。例如CITE-seq（cellularindexingoftranscriptomesandepitopesbysequencing）和REAP-seq，使用寡核苷酸（oligo）标记抗体同步检测细胞表面蛋白和转录本。但在实践中，这些方法会受到抗体特异性的限制，此外，每个抗体必须分别与一个独特的寡核苷酸条形码（barcode）进行偶联，采用这种标记方法无法实现大规模barcodes抗体库的构建及共享。最近出现的高通量测量表观组和蛋白组的技术也存在类似的问题。
年10月28日，来自哈佛大学-麻省理工学院布罗德研究所的AvivRegev团队在NatureBiotechnology杂志上在线发表了题为Single-cellprofilingofproteinsandchromatinaccessibilityusingPHAGE-ATAC的研究论文，开发了一种基于噬菌体的单细胞多模态测序方法PHAGE-ATAC，可以对染色质可及性和蛋白质进行量化分析，同时捕获线粒体DNA（mtDNA）用作天然克隆谱系示踪剂。此外，研究人员还构建了一个大规模的、可共享的PHAGE-ATACNanobodyLibrary（PANL），能够快速地产生用于PHAGE-ATAC的抗原特异性抗体（Phagenanobodys,pNbs）。
PHAGE-ATAC主要是通过纳米抗体识别抗原表位来量化蛋白（纳米抗体，nanobody,asingledomainantibody：骆驼体内存在天然的缺失轻链的重链抗体，克隆其可变区可以得到只有重链可变区组成的单域抗体，它是最小的功能性抗原结合片段。采用噬菌体展示技术可构建纳米抗体库）。每一个编码纳米抗体的噬菌体粒内包含的CDR3（hypervariable
转载请注明：http://www.0431gb208.com/sjszjzl/2982.html
