高通量测序技术
在过去的20年里，基因测序技术经历了一代测序、二代测序和三代测序的发展，在规模、通量以及应用上都有了极大地进步。高通量测序技术（high-throughputsequencing，HTS）又称下一代测序技术(nextgenerationsequencing，NGS)，以协同方式逐步进行酶促DNA反应、碱基测序与数据收集，可以同时完成数万条到数十亿条DNA模板的测序。自年第一台二代测序平台罗氏焦磷酸测序仪诞生以来，测序方法和技术不断更新换代，目前市场主流测序平台主要有Illumina和IonTorrent。然而二代测序读长较短导致在进行大基因组测序时拼接困难，较长的测序时间尚不能完全满足临床快速诊断的需求。在此背景下，可满足长读长和快速测序要求的三代测序（third-generationsequencing,TGS）平台应运而生。TGS不依赖于PCR扩增技术，能够对DNA单个分子进行合成测序，目前的应用平台主要有单分子实时测序（singlemoleculereal-time,SMRT）和纳米孔单分子测序。
DNA条形码技术
DNA宏条形码技术及应用
随着基因测序技术的发展和在线数据库，如美国国立生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI）、生命条形码数据系统（Barcodeoflifedatasystem,BOLD）的出现，近年来DNA宏条形码技术应运而生。它最初的定义是利用从环境样本中提取的DNA来进行高通量多物种的鉴定。DNA宏条形码技术结合了DNA条形码和高通量测序技术，为同时检测食物基质中的多个物种提供了理想的方法，包括产品中非预期的物种。因此，它比传统的DNA条形码功能更强大。为了鉴定未知样品中的物种，首先建立一个可靠的数据库，包含目标物种的DNA条形码。使用短链寡核苷酸对DNA提取物的条形码序列进行PCR扩增，然后合并来自不同样品的扩增子，在一次运行中对不同扩增子同时进行测序，并将序列与条形码数据库进行匹配，最后通过生物信息学分析得到结果。近年来，DNA宏条形码方法已应用于多个领域。例如，监测水生生态系统中的鱼类或土壤中的植物、鉴定糖果、乳制品、肉类衍生产品、复合或深加工海产品等食品中物种，以及测定蜂蜜、益生菌和中药补充剂的动植物来源等。由于DNA条形码方法提供了快速、准确和未知物种的识别，因此普遍认为该方法是一种很有前景的肉类掺假检测技术。
提取基因组DNA
MiSeq上机测序
总结展望
作为食品安全的主要问题之一，肉类及其制品的掺假问题近年来越来越受到人们的
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