近日，来自Garvan医学研究所的研究人员为免疫细胞开发出了特有的“条形码跟踪器”，通过基因测序技术能够从患者自身的免疫系统中发现对癌细胞有反应的罕见免疫细胞。
这项名为“RAGE-seq”的专利技术让人们首次能够追踪肿瘤组织内的免疫细胞是如何进化的，从而更好的改善免疫疗法。Garvan研究所执行主任克里斯·古德诺尔教授说道：“这项技术可以比作条形码追踪器，一次可以扫描数千个免疫细胞的详细信息。”
相关的研究结果也于7月16日发表在了最新的《NatureCommunications》上。
能“看见”癌细胞的免疫细胞
我们的免疫系统能够帮助人体抵御外来病原体、细菌、病毒。但是在癌症患者体内，往往由于免疫细胞过少或者无法发挥正常的功能而不能有效的清除癌细胞。
在人体内，由于细胞表面的“受体”类型不同，免疫细胞可以分为多种不同的类型。当遇到癌细胞时，有的免疫细胞负责传递信息，有的免疫细胞负责不断复制，一同杀灭癌细胞，有的免疫细胞则是辅助…
在所有的免疫细胞中，能够识别癌细胞的免疫细胞仅仅占据了一小部分。通常，我们需要对成千上万的细胞进行分类，才能够找到它们。
建立条码追踪器
以往的基因测序技术已经能够从单个细胞中读取编码不同受体的RNA，但是还没有办法在同一时间对肿瘤组织中成千上万的细胞进行测序和分类。而Garvan研究所的研究团队通过结合现有四种的不同基因测序技术开发了一种新方法：RAGE-seq（RepertoireandGeneExpressionbySequencing）。
研究人员首先开发了一种从单细胞中富集RNA的方法，靶向捕获T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)mRNA的长读长测序技术，然后他们开发了一种计算工具来精确读取免疫细胞受体的全长序列。
两种技术相结合进行的序列分析及基因表达就被称为RAGE-seq技术。就像条形码跟踪器一样，通过一次“扫描”成千上万个细胞中的相关免疫细胞受体，就可以提供组织样本中免疫细胞相关的精确快照，以及哪些细胞可以有效地杀灭癌细胞。
Garvan临床基因组中心基因组技术小组组长马丁·史密斯博士说道：“这种高通量策略确实为更详细地理解免疫反应的细胞动力学打开了大门”
利用这项技术，研究人员在一位三阴性乳腺癌患者的肿瘤和相关淋巴结组织中发现了个免疫细胞（个T细胞以及个B细胞），准确的揭示了患者肿瘤内免疫反应的特定基因特征。
癌症治疗的新策略
免疫疗法是一种新兴的癌症治疗即使，旨在激活免疫系统，促进免疫细胞更好的杀灭癌细胞，但并非所有患者都对免疫治疗有反应，事实上仅有20~40%采用免疫治疗才有效。
RAGE-seq技术可以帮助癌症患者以及医生了解体内免疫细胞的能力，是否能够有效识别癌细胞并清除癌症。帮助癌症患者更好的选择自己的治疗方案，避免在无效的治疗上浪费时间和金钱，并且承受不该有的痛苦。
目前该团队正在将这项技术应用于黑色素瘤患者中，希望通过RAGE-seq技术找到部分癌症患者接受免疫治疗无效的原因。同时研究人员认为，这种方法也可以用于更好地理解自身免疫性和炎性疾病。
参考资料：
1、Agenomicbarcodetrackerforimmunecells
2、MandeepSingh,GhamdanAl-Eryani,etal.High-throughputtargetedlong-readsinglecellsequencingrevealstheclonalandtranscriptionallandscapeoflymphocytes,NatureCommunications()
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